Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms