Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTUD4Q01804 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms