Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms