Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms