Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms