Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL7P80098 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL7P80098 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL7P80098 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL7P80098 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL7P80098 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL7P80098 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL7P80098 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL7P80098 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL7P80098 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL7P80098 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL7P80098 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL7P80098 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL7P80098 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL7P80098 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL7P80098 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL7P80098 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL7P80098 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL7P80098 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL7P80098 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL7P80098 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL7P80098 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL7P80098 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms