Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP2P78314 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2P78314 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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