Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms