Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCE1P61221 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms