Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMA6P60900 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms