Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms