Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1H2P55055 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms