Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF135P52742 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms