Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA2P51531 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms