Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ETV1P50549 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ETV1P50549 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ETV1P50549 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ETV1P50549 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ETV1P50549 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETV1P50549 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms