Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC4A3P48751 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms