Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms