Protein–RNA interactions for Protein: P40123

CAP2, Adenylyl cyclase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP2P40123 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAP2P40123 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CAP2P40123 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CAP2P40123 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAP2P40123 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAP2P40123 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CAP2P40123 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAP2P40123 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CAP2P40123 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAP2P40123 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms