Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms