Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRABP1P29762 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms