Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FGFR3P22607 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms