Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD247P20963 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD247P20963 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD247P20963 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD247P20963 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD247P20963 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD247P20963 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD247P20963 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD247P20963 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD247P20963 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD247P20963 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD247P20963 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD247P20963 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD247P20963 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD247P20963 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CD247P20963 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD247P20963 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms