Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms