Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDSP20132 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDSP20132 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDSP20132 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDSP20132 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDSP20132 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SDSP20132 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDSP20132 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDSP20132 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDSP20132 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDSP20132 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDSP20132 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDSP20132 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms