Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms