Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 331.6 ms