Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD53P19397 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD53P19397 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD53P19397 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms