Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF35P13682 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms