Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms