Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP2AP11388 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms