Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR2F1P10589 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2F1P10589 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms