Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms