Protein–RNA interactions for Protein: P04118

CLPS, Colipase, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSP04118 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLPSP04118 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPSP04118 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPSP04118 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPSP04118 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms