Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG7O95352 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG7O95352 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG7O95352 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG7O95352 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG7O95352 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG7O95352 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG7O95352 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG7O95352 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG7O95352 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG7O95352 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG7O95352 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG7O95352 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG7O95352 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG7O95352 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG7O95352 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG7O95352 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG7O95352 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG7O95352 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG7O95352 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG7O95352 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG7O95352 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG7O95352 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG7O95352 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG7O95352 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG7O95352 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG7O95352 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG7O95352 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG7O95352 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG7O95352 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG7O95352 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms