Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDIL3O43854 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDIL3O43854 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EDIL3O43854 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EDIL3O43854 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms