Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms