Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms