Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms