Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DXG7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DXG7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DXG7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DXG7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DXG7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DXG7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4DXG7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms