Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC160A6NGH7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms