Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms