Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC78A2IDD5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms