Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U3KQV3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U3KQV3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U3KQV3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U3KQV3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U3KQV3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U3KQV3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
U3KQV3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U3KQV3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQV3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQV3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQV3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQV3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQV3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQV3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQV3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQV3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQV3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQV3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQV3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQV3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U3KQV3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U3KQV3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U3KQV3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U3KQV3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U3KQV3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQV3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQV3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQV3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQV3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQV3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQV3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQV3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQV3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQV3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQV3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQV3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQV3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQV3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQV3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQV3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQV3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQV3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U3KQV3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U3KQV3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U3KQV3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U3KQV3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U3KQV3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U3KQV3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U3KQV3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
U3KQV3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U3KQV3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U3KQV3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U3KQV3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U3KQV3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQV3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQV3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQV3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQV3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQV3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQV3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQV3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQV3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQV3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQV3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQV3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQV3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQV3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQV3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQV3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQV3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQV3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQV3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQV3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQV3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQV3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQV3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQV3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQV3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQV3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQV3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQV3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQV3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQV3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQV3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQV3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQV3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQV3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQV3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQV3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQV3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQV3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQV3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQV3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQV3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQV3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQV3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQV3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U3KQV3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U3KQV3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms