Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX13Q9Y5W8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX13Q9Y5W8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX13Q9Y5W8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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