Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNPO3Q9Y5L0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms