Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
KIF3AQ9Y496 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIF3AQ9Y496 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms