Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIP1Q9Y3R0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIP1Q9Y3R0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms