Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCN4Q9Y3Q4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN4Q9Y3Q4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HCN4Q9Y3Q4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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