Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
REXO2Q9Y3B8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
REXO2Q9Y3B8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REXO2Q9Y3B8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms