Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L9

LRCH1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH1Q9Y2L9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRCH1Q9Y2L9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRCH1Q9Y2L9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms